Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCAQ16586 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms