Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.89e-33■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 CSNK2B-206ENST00000468255 1792 ntTSL 516.34■□□□□ 0.219e-33■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.239e-33■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.269e-33■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 AL662899.3-201ENST00000375880 2487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.49e-33■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.849e-33■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 SEC31A-240ENST00000515062 597 ntTSL 37.15□□□□□ -1.267e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SEC31A-216ENST00000505479 631 ntTSL 26.54□□□□□ -1.367e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.427e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.447e-9■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 CIZ1-201ENST00000277465 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.339e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CIZ1-207ENST00000393608 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.399e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CIZ1-208ENST00000415526 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.7□□□□□ -0.549e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 PRKCSH-208ENST00000589126 625 ntTSL 516.25■□□□□ 0.192e-10■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 PRKCSH-220ENST00000593104 545 ntTSL 413.76□□□□□ -0.212e-10■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.543e-12■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-12■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-12■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 SLC43A3-226ENST00000625097 1796 nt8.91□□□□□ -0.983e-12■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 TALDO1-206ENST00000530666 587 ntTSL 218.14■□□□□ 0.493e-7■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.336e-7■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.246e-7■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.16e-7■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.216e-7■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 219.67■□□□□ 0.741e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.541e-8■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 ERCC1-213ENST00000592023 738 ntTSL 518.3■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.369e-14■■■□□ 15.1
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PABPC4Q13310 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-14■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-14■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.963e-14■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.117e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.767e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 RPS28-201ENST00000417088 334 ntTSL 218.15■□□□□ 0.59e-9■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.694e-8■■■□□ 15.1
PABPC4Q13310 HAT1-206ENST00000494601 3845 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-6■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-25■■■□□ 15
PABPC4Q13310 TOMM7-205ENST00000483581 551 ntTSL 1 (best)2.07□□□□□ -2.082e-25■■■□□ 15
PABPC4Q13310 VPS35-210ENST00000568784 4017 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.355e-7■■■□□ 15
PABPC4Q13310 PTOV1-208ENST00000597730 327 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-10■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-222ENST00000570086 801 ntTSL 318.2■□□□□ 0.51e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-220ENST00000569187 612 ntTSL 216.43■□□□□ 0.221e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.011e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-206ENST00000563779 2087 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.11e-9■■■□□ 15
PABPC4Q13310 CMC2-217ENST00000566918 605 ntTSL 37.56□□□□□ -1.21e-9■■■□□ 15
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