Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SHMT1-207ENST00000580002 1759 ntTSL 224.42■■□□□ 1.56e-6■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 SHMT1-206ENST00000579558 1077 ntTSL 223.76■■□□□ 1.396e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.086e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SHMT1-209ENST00000582653 879 ntTSL 320.39■□□□□ 0.856e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.836e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.816e-6■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 216.91■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 PQLC1-212ENST00000590895 865 ntTSL 316.81■□□□□ 0.286e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.126e-6■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.136e-6■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 PQLC1-205ENST00000469369 593 ntTSL 413.5□□□□□ -0.256e-6■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 RALGAPA1-205ENST00000553917 723 ntTSL 32.7□□□□□ -1.987e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-7■□□□□ 10.2
ILF3Q12906 WASF2-201ENST00000536657 1083 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-7■□□□□ 10.2
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ILF3Q12906 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.139e-7■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.79e-7■□□□□ 10.1
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ILF3Q12906 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 310.48□□□□□ -0.731e-6■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.183e-8■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.732e-9■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.02□□□□□ -2.252e-9■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-11■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IL2RG-209ENST00000512747 1971 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-11■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IL2RG-201ENST00000276110 2035 ntTSL 212.85□□□□□ -0.351e-11■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-11■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 314.25□□□□□ -0.131e-9■□□□□ 10.1
ILF3Q12906 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-6■□□□□ 10
ILF3Q12906 NR2F6-202ENST00000596878 731 ntTSL 324.87■■□□□ 1.571e-6■□□□□ 10
ILF3Q12906 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 10
ILF3Q12906 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 10
ILF3Q12906 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-9■□□□□ 10
ILF3Q12906 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.39e-9■□□□□ 10
ILF3Q12906 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.712e-8■□□□□ 10
ILF3Q12906 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 221.36■■□□□ 1.013e-7■□□□□ 10
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