Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms