Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HACD2Q6Y1H2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms