Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALCOCO2Q13137 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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