Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLTPP55058 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms