Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TGFBR1P36897 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms