Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms