Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RPS6KB2-211ENST00000531765 723 ntTSL 318.78■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-241ENST00000460944 1248 ntTSL 518.6■□□□□ 0.572e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RPS6KB2-208ENST00000526268 787 ntTSL 318.4■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 318.24■□□□□ 0.512e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 418.03■□□□□ 0.482e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-277ENST00000515219 481 ntTSL 517.5■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RPS6KB2-207ENST00000525996 957 ntTSL 517.49■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-235ENST00000428153 1257 ntTSL 517.29■□□□□ 0.362e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-246ENST00000485023 515 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-234ENST00000424544 587 ntTSL 416.11■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 LAP3-208ENST00000512397 689 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-264ENST00000508472 836 ntTSL 415.61■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 TUBG2-202ENST00000588870 1776 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RPS6KB2-205ENST00000525088 5528 ntTSL 214.63□□□□□ -0.072e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-260ENST00000507533 545 ntTSL 213.52□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 TUBG2-203ENST00000590396 856 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.342e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 DDR1-224ENST00000376567 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 FRMD8-204ENST00000525156 380 ntTSL 512.31□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 LAP3-207ENST00000509583 887 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.572e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 DDR1-239ENST00000452441 3857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 39.75□□□□□ -0.852e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.08□□□□□ -1.442e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.022e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 MRPL32-203ENST00000432845 2734 ntTSL 211.02□□□□□ -0.655e-7■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-6■■■□□ 16.7
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RBM22Q9NW64 SLC22A23-212ENST00000497691 2555 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 SLC22A23-209ENST00000485307 1574 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 38.25□□□□□ -1.094e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 SORBS3-216ENST00000523348 680 ntTSL 213.08□□□□□ -0.324e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 MAP4K4-208ENST00000418101 776 ntTSL 310.44□□□□□ -0.744e-6■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-205ENST00000585913 833 ntTSL 321.69■■□□□ 1.065e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 15e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-209ENST00000586555 716 ntTSL 220.74■□□□□ 0.912e-8■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.915e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-220ENST00000588917 1087 ntTSL 219.87■□□□□ 0.772e-8■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-245ENST00000621399 1044 ntTSL 1 (best)18.83■□□□□ 0.62e-8■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 MFGE8-210ENST00000559259 611 ntTSL 218.46■□□□□ 0.555e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-232ENST00000591376 830 ntTSL 318.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-237ENST00000592234 571 ntTSL 518.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-210ENST00000586636 938 ntTSL 218.27■□□□□ 0.525e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-203ENST00000444172 584 ntTSL 318.19■□□□□ 0.52e-8■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-8■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 INTS8-220ENST00000524333 3272 ntTSL 217.46■□□□□ 0.395e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.365e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-206ENST00000585914 1052 ntTSL 517.07■□□□□ 0.325e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-212ENST00000587169 3028 ntTSL 216.95■□□□□ 0.35e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 INTS8-214ENST00000523206 3351 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.155e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 INTS8-201ENST00000343161 3434 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.145e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-228ENST00000590347 3117 ntTSL 214.73□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 CIRBP-242ENST00000593093 3528 ntTSL 214.26□□□□□ -0.135e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 INTS8-217ENST00000523731 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.345e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 MFGE8-216ENST00000613965 456 ntTSL 510.13□□□□□ -0.795e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.145e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RPL35A-209ENST00000496582 579 ntTSL 27.07□□□□□ -1.285e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 INTS8-216ENST00000523352 508 ntTSL 56.32□□□□□ -1.45e-7■■■□□ 16.7
RBM22Q9NW64 RPL35A-201ENST00000329092 456 ntTSL 35.53□□□□□ -1.525e-7■■■□□ 16.7
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