RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.38■■■■■ 4.37
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.84■■■■□ 3.65
MFGE8-210ENST00000559259 ABCC9O60706 1549 aa37.29■■■■□ 3.56
MFGE8-210ENST00000559259 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.7■■■■□ 3.31
MFGE8-210ENST00000559259 NACADO15069 1562 aa35.54■■■■□ 3.28
MFGE8-210ENST00000559259 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
MFGE8-210ENST00000559259 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.24■■■■□ 3.23
MFGE8-210ENST00000559259 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.2■■■■□ 3.23
MFGE8-210ENST00000559259 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.18■■■■□ 3.22
MFGE8-210ENST00000559259 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.11■■■■□ 3.21
MFGE8-210ENST00000559259 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.74■■■■□ 3.15
MFGE8-210ENST00000559259 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.67■■■■□ 3.14
MFGE8-210ENST00000559259 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.51■■■■□ 3.12
MFGE8-210ENST00000559259 SCRIBQ14160 1630 aa34.49■■■■□ 3.11
MFGE8-210ENST00000559259 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.21■■■■□ 3.07
MFGE8-210ENST00000559259 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
MFGE8-210ENST00000559259 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.77■■■■□ 3
MFGE8-210ENST00000559259 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.52■■■□□ 2.96
MFGE8-210ENST00000559259 SMARCA4P51532 1647 aa32.94■■■□□ 2.86
MFGE8-210ENST00000559259 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
MFGE8-210ENST00000559259 NCAPD3P42695 1498 aa32.75■■■□□ 2.83
MFGE8-210ENST00000559259 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.75■■■□□ 2.83
MFGE8-210ENST00000559259 SMARCA2P51531 1590 aa32.7■■■□□ 2.83
MFGE8-210ENST00000559259 HMGXB3Q12766 1538 aa32.67■■■□□ 2.82
MFGE8-210ENST00000559259 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
MFGE8-210ENST00000559259 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.62■■■□□ 2.81
MFGE8-210ENST00000559259 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.59■■■□□ 2.81
MFGE8-210ENST00000559259 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
MFGE8-210ENST00000559259 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
MFGE8-210ENST00000559259 WIZO95785 1651 aa32.27■■■□□ 2.76
MFGE8-210ENST00000559259 NESP48681 1621 aa32.2■■■□□ 2.75
MFGE8-210ENST00000559259 ERCC6Q03468 1493 aa32.12■■■□□ 2.73
MFGE8-210ENST00000559259 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
MFGE8-210ENST00000559259 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
MFGE8-210ENST00000559259 CUX2O14529 1486 aa31.94■■■□□ 2.7
MFGE8-210ENST00000559259 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.92■■■□□ 2.7
MFGE8-210ENST00000559259 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
MFGE8-210ENST00000559259 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.73■■■□□ 2.67
MFGE8-210ENST00000559259 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.69■■■□□ 2.66
MFGE8-210ENST00000559259 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.65■■■□□ 2.66
MFGE8-210ENST00000559259 CFTRP13569 1480 aa31.53■■■□□ 2.64
MFGE8-210ENST00000559259 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.51■■■□□ 2.63
MFGE8-210ENST00000559259 PRDM2Q13029 1718 aa31.49■■■□□ 2.63
MFGE8-210ENST00000559259 WDR62O43379 1518 aa31.48■■■□□ 2.63
MFGE8-210ENST00000559259 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.46■■■□□ 2.63
MFGE8-210ENST00000559259 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.46■■■□□ 2.63
MFGE8-210ENST00000559259 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.29■■■□□ 2.6
MFGE8-210ENST00000559259 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
MFGE8-210ENST00000559259 TOPBP1Q92547 1522 aa30.94■■■□□ 2.54
MFGE8-210ENST00000559259 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.91■■■□□ 2.54
MFGE8-210ENST00000559259 IFT140Q96RY7 1462 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-210ENST00000559259 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-210ENST00000559259 ABCC8Q09428 1581 aa30.79■■■□□ 2.52
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
MFGE8-210ENST00000559259 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-210ENST00000559259 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
MFGE8-210ENST00000559259 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
MFGE8-210ENST00000559259 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
MFGE8-210ENST00000559259 CUX1P39880 1505 aa30.61■■■□□ 2.49
MFGE8-210ENST00000559259 TOP2BQ02880 1626 aa30.58■■■□□ 2.49
MFGE8-210ENST00000559259 TRIM41Q8WV44 630 aa30.57■■■□□ 2.48
MFGE8-210ENST00000559259 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.57■■■□□ 2.48
MFGE8-210ENST00000559259 SYNJ1O43426 1573 aa30.55■■■□□ 2.48
MFGE8-210ENST00000559259 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.53■■■□□ 2.48
MFGE8-210ENST00000559259 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.51■■■□□ 2.48
MFGE8-210ENST00000559259 WDR97A6NE52 1622 aa30.47■■■□□ 2.47
MFGE8-210ENST00000559259 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.474e-8■■■■■ 43.8
MFGE8-210ENST00000559259 CHD1O14646 1710 aa30.44■■■□□ 2.46
MFGE8-210ENST00000559259 SOGA1O94964 1423 aa30.41■■■□□ 2.46
MFGE8-210ENST00000559259 OSCARQ8IYS5 282 aa30.36■■■□□ 2.45
MFGE8-210ENST00000559259 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
MFGE8-210ENST00000559259 PBRM1Q86U86 1689 aa30.27■■■□□ 2.44
MFGE8-210ENST00000559259 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.24■■■□□ 2.43
MFGE8-210ENST00000559259 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-210ENST00000559259 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-210ENST00000559259 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-210ENST00000559259 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.22■■■□□ 2.43
MFGE8-210ENST00000559259 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.18■■■□□ 2.42
MFGE8-210ENST00000559259 EEA1Q15075 1411 aa30.16■■■□□ 2.42
MFGE8-210ENST00000559259 GRIN2BQ13224 1484 aa30.15■■■□□ 2.42
MFGE8-210ENST00000559259 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
MFGE8-210ENST00000559259 ARHGEF11O15085 1522 aa30.11■■■□□ 2.41
MFGE8-210ENST00000559259 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.1■■■□□ 2.41
MFGE8-210ENST00000559259 KIF27Q86VH2 1401 aa30.05■■■□□ 2.4
MFGE8-210ENST00000559259 FBLN2P98095 1184 aa30.04■■■□□ 2.4
MFGE8-210ENST00000559259 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.02■■■□□ 2.4
MFGE8-210ENST00000559259 SYNJ2O15056 1496 aa30.02■■■□□ 2.4
MFGE8-210ENST00000559259 ADAMTS12P58397 1594 aa29.95■■■□□ 2.39
MFGE8-210ENST00000559259 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.91■■■□□ 2.38
MFGE8-210ENST00000559259 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
MFGE8-210ENST00000559259 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.86■■■□□ 2.37
MFGE8-210ENST00000559259 ARAP1Q96P48 1450 aa29.86■■■□□ 2.37
MFGE8-210ENST00000559259 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.81■■■□□ 2.36
MFGE8-210ENST00000559259 GRIN2AQ12879 1464 aa29.8■■■□□ 2.36
MFGE8-210ENST00000559259 IGF1RP08069 1367 aa29.78■■■□□ 2.36
MFGE8-210ENST00000559259 CEP170Q5SW79 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
MFGE8-210ENST00000559259 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
MFGE8-210ENST00000559259 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.72■■■□□ 2.35
MFGE8-210ENST00000559259 PRXQ9BXM0 1461 aa29.72■■■□□ 2.35
MFGE8-210ENST00000559259 KIF21BO75037 1637 aa29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms