RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525088.5

RPS6KB2-205, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B2, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KB2, Length 5,528 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2-205ENST00000525088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.83■■□□□ 1.73
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RPS6KB2-205ENST00000525088 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RPS6KB2-205ENST00000525088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB2-205ENST00000525088 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.91■■□□□ 1.26
RPS6KB2-205ENST00000525088 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.61■■□□□ 1.21
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RPS6KB2-205ENST00000525088 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS6KB2-205ENST00000525088 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB2-205ENST00000525088 ABCC9O60706 1549 aa22.29■■□□□ 1.16
RPS6KB2-205ENST00000525088 APLP2Q06481 763 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS6KB2-205ENST00000525088 MYT1Q01538 1121 aa22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB2-205ENST00000525088 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB2-205ENST00000525088 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
RPS6KB2-205ENST00000525088 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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RPS6KB2-205ENST00000525088 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KB2-205ENST00000525088 NEFLP07196 543 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KB2-205ENST00000525088 TRIM41Q8WV44 630 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB2-205ENST00000525088 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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RPS6KB2-205ENST00000525088 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2-205ENST00000525088 HRCP23327 699 aa21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2-205ENST00000525088 SCRIBQ14160 1630 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS6KB2-205ENST00000525088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.08■□□□□ 0.97
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RPS6KB2-205ENST00000525088 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.96■□□□□ 0.95
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RPS6KB2-205ENST00000525088 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
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RPS6KB2-205ENST00000525088 ITGAEP38570 1179 aa20.89■□□□□ 0.93
RPS6KB2-205ENST00000525088 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
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RPS6KB2-205ENST00000525088 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.86■□□□□ 0.93
RPS6KB2-205ENST00000525088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.79■□□□□ 0.92
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RPS6KB2-205ENST00000525088 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.62■□□□□ 0.89
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RPS6KB2-205ENST00000525088 ERCC6Q03468 1493 aa20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB2-205ENST00000525088 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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RPS6KB2-205ENST00000525088 ARID3CA6NKF2 412 aa19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB2-205ENST00000525088 P3H3Q8IVL6 736 aa19.98■□□□□ 0.79
RPS6KB2-205ENST00000525088 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.97■□□□□ 0.79
RPS6KB2-205ENST00000525088 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
RPS6KB2-205ENST00000525088 EEA1Q15075 1411 aa19.89■□□□□ 0.77
RPS6KB2-205ENST00000525088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
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RPS6KB2-205ENST00000525088 FKBP8Q14318 412 aa19.86■□□□□ 0.77
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RPS6KB2-205ENST00000525088 SLC24A1O60721 1099 aa19.82■□□□□ 0.76
RPS6KB2-205ENST00000525088 WIZO95785 1651 aa19.81■□□□□ 0.76
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RPS6KB2-205ENST00000525088 GOLGA3Q08378 1498 aa19.76■□□□□ 0.75
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RPS6KB2-205ENST00000525088 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.75■□□□□ 0.75
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RPS6KB2-205ENST00000525088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.71■□□□□ 0.75
RPS6KB2-205ENST00000525088 SMARCA4P51532 1647 aa19.7■□□□□ 0.74
RPS6KB2-205ENST00000525088 CEP162Q5TB80 1403 aa19.66■□□□□ 0.74
RPS6KB2-205ENST00000525088 CLIP1P30622 1438 aa19.65■□□□□ 0.74
RPS6KB2-205ENST00000525088 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.63■□□□□ 0.73
RPS6KB2-205ENST00000525088 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.62■□□□□ 0.73
RPS6KB2-205ENST00000525088 NEFMP07197 916 aa19.61■□□□□ 0.73
RPS6KB2-205ENST00000525088 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
RPS6KB2-205ENST00000525088 KIF27Q86VH2 1401 aa19.58■□□□□ 0.73
RPS6KB2-205ENST00000525088 ABCC8Q09428 1581 aa19.57■□□□□ 0.72
RPS6KB2-205ENST00000525088 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
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