Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYDE1Q6ZW31 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms