Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
E2F1Q01094 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F1Q01094 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms