Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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CASQ1P31415 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASQ1P31415 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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