Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HMGB1P1B2RPK0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms