Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
FHOD3Q2V2M9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FHOD3Q2V2M9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms