Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GTF2H3Q13889 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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GTF2H3Q13889 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GTF2H3Q13889 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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