Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG1Q06432 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNG1Q06432 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms