Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2BFSP57053 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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