Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX2P48431 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX2P48431 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX2P48431 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX2P48431 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX2P48431 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX2P48431 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms