Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SENP6Q9GZR1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SENP6Q9GZR1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms