Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAT1Q99536 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms