Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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UBE4AQ14139 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE4AQ14139 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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