Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FBXW4P57775 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms