Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COMMD3Q9UBI1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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