Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
COMMD3Q9UBI1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COMMD3Q9UBI1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COMMD3Q9UBI1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COMMD3Q9UBI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
COMMD3Q9UBI1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COMMD3Q9UBI1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COMMD3Q9UBI1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COMMD3Q9UBI1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COMMD3Q9UBI1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COMMD3Q9UBI1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COMMD3Q9UBI1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COMMD3Q9UBI1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COMMD3Q9UBI1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COMMD3Q9UBI1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COMMD3Q9UBI1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COMMD3Q9UBI1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COMMD3Q9UBI1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COMMD3Q9UBI1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COMMD3Q9UBI1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COMMD3Q9UBI1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COMMD3Q9UBI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COMMD3Q9UBI1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COMMD3Q9UBI1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COMMD3Q9UBI1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COMMD3Q9UBI1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COMMD3Q9UBI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COMMD3Q9UBI1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COMMD3Q9UBI1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COMMD3Q9UBI1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COMMD3Q9UBI1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COMMD3Q9UBI1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COMMD3Q9UBI1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COMMD3Q9UBI1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COMMD3Q9UBI1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COMMD3Q9UBI1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
COMMD3Q9UBI1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COMMD3Q9UBI1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COMMD3Q9UBI1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
COMMD3Q9UBI1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COMMD3Q9UBI1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COMMD3Q9UBI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COMMD3Q9UBI1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COMMD3Q9UBI1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COMMD3Q9UBI1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COMMD3Q9UBI1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COMMD3Q9UBI1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COMMD3Q9UBI1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COMMD3Q9UBI1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COMMD3Q9UBI1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COMMD3Q9UBI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
COMMD3Q9UBI1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COMMD3Q9UBI1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COMMD3Q9UBI1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COMMD3Q9UBI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COMMD3Q9UBI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COMMD3Q9UBI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COMMD3Q9UBI1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COMMD3Q9UBI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD3Q9UBI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COMMD3Q9UBI1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COMMD3Q9UBI1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COMMD3Q9UBI1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COMMD3Q9UBI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COMMD3Q9UBI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD3Q9UBI1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD3Q9UBI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COMMD3Q9UBI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COMMD3Q9UBI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD3Q9UBI1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COMMD3Q9UBI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD3Q9UBI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COMMD3Q9UBI1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COMMD3Q9UBI1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COMMD3Q9UBI1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COMMD3Q9UBI1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COMMD3Q9UBI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COMMD3Q9UBI1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COMMD3Q9UBI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COMMD3Q9UBI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3Q9UBI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3Q9UBI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COMMD3Q9UBI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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