Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MFSD3Q96ES6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms