Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.244e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.034e-7■■■□□ 15.6
PABPC4Q13310 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.532e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.852e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPL8-210ENST00000531767 570 ntTSL 518.77■□□□□ 0.62e-36■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.11e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PRRC2B-208ENST00000465931 5366 ntTSL 213.93□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 213.68□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DDA1-202ENST00000593466 757 ntTSL 323.74■■□□□ 1.391e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DDA1-204ENST00000596582 502 ntTSL 323.06■■□□□ 1.281e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DDA1-201ENST00000359866 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.273e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 USP39-212ENST00000465514 660 ntTSL 312.13□□□□□ -0.474e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 522.49■■□□□ 1.196e-14■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPL8-212ENST00000532702 745 ntTSL 218.38■□□□□ 0.531e-36■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.277e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.495e-10■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.114e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.34e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 28.58□□□□□ -1.042e-10■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-10■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-10■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RRM1-213ENST00000533495 2381 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-10■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AL365205.1-201ENST00000456057 3947 ntTSL 218.07■□□□□ 0.482e-28■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AL365205.1-203ENST00000335515 2871 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-28■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AL365205.1-202ENST00000487182 3043 ntTSL 213.96□□□□□ -0.172e-28■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TOMM6-201ENST00000398881 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-28■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-28■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.681e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 BAX-208ENST00000503726 488 ntTSL 219.41■□□□□ 0.75e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 POLR2A-209ENST00000617998 6751 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.333e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPL10-213ENST00000482732 1731 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.422e-15■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 GSTP1-203ENST00000467591 736 ntTSL 213.79□□□□□ -0.27e-35■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.463e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 LRPAP1-201ENST00000296325 1078 ntTSL 1 (best)22.14■■□□□ 1.136e-17■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.914e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CHAF1A-207ENST00000589648 563 ntTSL 518.37■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.283e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 NIPSNAP2-204ENST00000446692 662 ntTSL 415.52■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.036e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.244e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 THYN1-201ENST00000341541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.286e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 THYN1-204ENST00000392595 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.286e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RPS8-207ENST00000485390 1115 ntTSL 1 (best)25.82■■□□□ 1.723e-50■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SLC5A6-213ENST00000461757 2307 ntTSL 219.92■□□□□ 0.786e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 212.97□□□□□ -0.336e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.396e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RAD23A-208ENST00000591499 1350 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 RAD23A-202ENST00000586375 894 ntTSL 318.67■□□□□ 0.581e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP1R37-204ENST00000540059 1719 ntTSL 224.79■■□□□ 1.562e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP1R37-202ENST00000422370 5943 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.321e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 SLC30A5-206ENST00000511158 763 ntTSL 27.78□□□□□ -1.161e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 527.42■■□□□ 1.982e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.115e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.245e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.255e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.435e-11■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.952e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.882e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TRIM41-204ENST00000508930 3834 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.072e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-13■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-13■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-13■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.616e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.716e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-210ENST00000526307 4134 ntTSL 28.43□□□□□ -1.066e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.096e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 UXT-204ENST00000460840 476 ntTSL 25.87□□□□□ -1.472e-8■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.381e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.971e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.931e-6■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.091e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.041e-7■■■□□ 15.5
PABPC4Q13310 STXBP2-211ENST00000597068 1785 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 15.5
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 144.2 ms