Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms