Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SOCS1O15524 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms