Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RCVRNP35243 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms