Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXB7P09629 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms