Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H6

KCNE3, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE3Q9Y6H6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE3Q9Y6H6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE3Q9Y6H6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNE3Q9Y6H6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms