Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX9Q9Y5X1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX9Q9Y5X1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX9Q9Y5X1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX9Q9Y5X1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms