Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB9Q9Y5E1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB9Q9Y5E1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB9Q9Y5E1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB9Q9Y5E1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms