Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D5

MRPS18C, 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18CQ9Y3D5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18CQ9Y3D5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18CQ9Y3D5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS18CQ9Y3D5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms