Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN22Q9Y2R2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN22Q9Y2R2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPN22Q9Y2R2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN22Q9Y2R2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN22Q9Y2R2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms