Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DENND2AQ9ULE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DENND2AQ9ULE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DENND2AQ9ULE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DENND2AQ9ULE3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DENND2AQ9ULE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms