Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC2Q9UKJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC2Q9UKJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
CHIC2Q9UKJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CHIC2Q9UKJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms