Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DKK4Q9UBT3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DKK4Q9UBT3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DKK4Q9UBT3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DKK4Q9UBT3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms