Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PKD2L2Q9NZM6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKD2L2Q9NZM6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKD2L2Q9NZM6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKD2L2Q9NZM6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms