Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN3Q9NZ94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN3Q9NZ94 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLGN3Q9NZ94 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLGN3Q9NZ94 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms