Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DLL3Q9NYJ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DLL3Q9NYJ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DLL3Q9NYJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms