Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL28Q9NXS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL28Q9NXS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL28Q9NXS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms