Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ING3Q9NXR8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ING3Q9NXR8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ING3Q9NXR8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ING3Q9NXR8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms