Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IMP3Q9NV31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IMP3Q9NV31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IMP3Q9NV31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms