Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KRT82Q9NSB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT82Q9NSB4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT82Q9NSB4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT82Q9NSB4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms