Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSS2Q9NR19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACSS2Q9NR19 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACSS2Q9NR19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSS2Q9NR19 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms