Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FZD3Q9NPG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FZD3Q9NPG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FZD3Q9NPG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FZD3Q9NPG1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms